<div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">---------- Forwarded message ---------<br>From: Platon workaccount <<a href="mailto:platon.work@gmail.com">platon.work@gmail.com</a>><br>Date: вт, 22 мар. 2016 г. в 14:58<br>Subject: Ensembl VEP: FASTA gzip to bgzip conversion failed<br>To:  <<a href="mailto:dev@ensembl.org">dev@ensembl.org</a>><br></div><br><br><div dir="ltr"><div>Hello.<br><br>Full API end dependencies are installed (bioperl-live, ensembl, ensembl-compara, ensembl-variation, ensembl-funcgen; tabix; DBI, DBD::mysql); environment is set up<br>my $API_VERSION = 84<br></div>ubuntu-15.10-desktop-amd64<br><br>Error of converting sequence data:<br><br><div><div>? 28<br>- downloading Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assembly.fa.gz<br>- converting sequence data to bgzip format<br>Going to run:<br>./biodbhts/scripts/convert_gz_2_bgz.sh /home/pl/.vep/homo_sapiens/84_GRCh38/Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assembly.fa.gz ./htslib/bgzip<br>This may take some time and will be removed when files are provided in bgzip format<br>/bin/bash: ./biodbhts/scripts/convert_gz_2_bgz.sh: <span lang="en"><span>No such file</span> <span>or directory</span></span><br>FASTA gzip to bgzip conversion failed:<br></div></div></div></div></div>