<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Hi Will,</div><div><br></div><div>Thank you for the response.  Yes, initially I got the stats from the Ensembl assembly page.  However, I figured not all gene models made it into VEP through some filtering criteria, so it would be nice to know how many gene models/transcripts are in the VEP database.</div><div><br></div><div>I'll read about plugin development.  I could see this naievly working by looping through the serialized Perl objects and just getting a list of genes/transcripts.  I'm assuming this is being done to check the variant effect when looking up a mutation in a VCF file.</div><div><br></div><div>Thank you.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>-Hans</div></div></div></div>
</div></div>