<div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>We are trying to generate whole genome sequences for 25,000 samples using short read data form Illumina. This will be used in many downstream analyses and other related projects.</div><div><br></div><div>1) Would you recommend to go for GRCH37 or GRCH38?</div><div><br></div><div>2) For the annotation, what are the main advantages to adopting VEP as the annotator tool? especially in linking with public databases and comparing to other genomics studies.</div><div><br></div><div>Thank you,<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">G.</div></div>
</div></div>