
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div class="">Hello,</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">I attach a list of SNPs (rsids1.txt), the output when using hg38 (out_0_rsids1.txt) and hg19 (out_0_rsids1_hg19.txt). The local vcf files were the same for the generation of both out files, as far as I know. I also attach the script used again.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">hg38 got 7233 LD variants, hg19 got 7246.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Best,</div>

<div class="">Johanne</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class=""></div>

</body>

</html>