<div dir="ltr">Hello,<div><br>We (Ensembl) do not have gVCF files for 1000 genomes individuals, and I don't believe the 1000 Genomes team provides these either.</div><div><br></div><div>A quick google suggests that some have generated their own from the BAM files [1] which are available from the 1000 Genomes FTP site [2].</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div><div><br></div><div>[1] : <a href="https://www.biostars.org/p/196066/">https://www.biostars.org/p/196066/</a></div><div>[2] : <a href="ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/data">ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/data</a></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 20 August 2016 at 08:58, Genomeo Dev <span dir="ltr"><<a href="mailto:genomeodev@gmail.com" target="_blank">genomeodev@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear 1000 genomes/dev team,<div><br></div><div>Is it possible to get hold of a gvcf file for at least a few individuals from 1000 genomes?</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><div><br></div>-- <br><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">G.</div></div>
</div></font></span></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.ensembl.org/<wbr>mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>