<div dir="ltr"><p>Dear all,</p>
<p>
</p>
<p>I would like to share a VEP Plugin f(PON_P2) for obtaining predictions from PON-P2.</p>
<p>
</p>
<p>PON-P2 is a machine learning-based tool for predicting pathogenicity 
of amino acid substitutions in human proteins. The method computes 
reliability score for each variant and classifies them into three groups
 (Pathogenic, Neutral and Unknown) based on the predicted score and the 
reliability. The article describing PON-P2 is published in PLoS One (<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25647319" target="_blank" id="gmail-LPlnk580271" title="Ctrl+Click or tap to follow the link">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25647319</a>). The tool is available at <a href="http://structure.bmc.lu.se/PON-P2" target="_blank" id="gmail-LPlnk449425" title="Ctrl+Click or tap to follow the link">http://structure.bmc.lu.se/PON-P2/.</a></p>

<p>
</p>
<p>The plugin and a supporting python script required to connect to 
PON-P2 server is attached with this email. You can also find the scripts
 and more information about the plugin at <a href="http://structure.bmc.lu.se/PON-P2/vep.html/" target="_blank" id="gmail-LPlnk379464">http://structure.bmc.lu.se/PON-P2/vep.html/</a>.<br>
</p>

<p><br></p><p>
Best Regards<br></p>
Abhishek Niroula<br>
Department of Experimental Medical Science<br>
Faculty of Medicine, Lund University<br>
Lund, Sweden</div>