<div dir="ltr">Hi <br><br>I am trying to use the ensemble converter for maize.<br><br><a href="http://plants.ensembl.org/Zea_mays/Tools/AssemblyConverter?db=core">http://plants.ensembl.org/Zea_mays/Tools/AssemblyConverter?db=core</a><br clear="all"><div><br></div><div>However, I can found it only to convert from version AGPv3 -> AGPv4 and vice versa, I want to convert AGPv2 -> AGPv3 converting vcf files. <br>How I can do this?<br><br></div><div>I am also trying with CrossMap <a href="http://crossmap.sourceforge.net">http://crossmap.sourceforge.net</a>, but I do not have  a  chain file to use it. Anny suggestions?<br><br> <br></div><div>-- <br><div class="gmail_signature">Eric</div>
</div></div>