<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <p>
      <meta charset="utf-8">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">Hello,</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">I have two
        variants and would like to know how can i compute the frequency
        and genotype  of each of the alleles and then the frequency of
        both combined and individually.</span><br style="color: rgb(34,
        34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">The idea is to
        estimate in the 1000 genomes the frequency of each variation and
        their prevalence when combined in the same individual (with all
        allele possiblities)</span><br style="color: rgb(34, 34, 34);
        font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style:
        normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps:
        normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">For example if
        varA = 80%A / 20%T and varB =40%G and 60%C</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">What is the
        frequence for varA = 80% Aand varB=40%G in the population. Same
        for varA = 80%A and varB = 60%C</span><br style="color: rgb(34,
        34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">So far i have
        managed to get frequencies for each variation individually (the
        code below is en example for one variant).</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">The two 
        variants are rs1333049 and rs7046863</span><br style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">I´m using API
        version 86</span><br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family:
        arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">use strict;</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">use warnings;</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">use
        Bio::EnsEMBL::Registry;</span><br style="color: rgb(34, 34, 34);
        font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style:
        normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps:
        normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">my $registry =
        'Bio::EnsEMBL::Registry';</span><br style="color: rgb(34, 34,
        34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">$registry->load_registry_from_</span></p>
    <p><wbr style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);"><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">db(</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">    -host =>
        '</span><a href="http://ensembldb.ensembl.org/" rel="noreferrer"
        target="_blank"
data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=es&q=http://ensembldb.ensembl.org&source=gmail&ust=1478790033013000&usg=AFQjCNGXmmBo6mZL1dmvgwVbZTuB_caJRQ"
        style="color: rgb(17, 85, 204); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">ensembldb.ensembl.org</a><span
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">',</span><br style="color: rgb(34, 34,
        34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">    -user =>
        'anonymous'</span><br style="color: rgb(34, 34, 34);
        font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style:
        normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps:
        normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">    );</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">my
        $variation_adaptor = $registry->get_adaptor('human'</span><wbr
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">, 'variation', 'variation');</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;"># Retrieve 1000
        genomes phase 3 data</span><br style="color: rgb(34, 34, 34);
        font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style:
        normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps:
        normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">$variation_adaptor->db->use_vc</span><wbr
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">f(1);</span><br style="color: rgb(34,
        34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">my $variation =
        $variation_adaptor->fetch_by_n</span><wbr style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">ame('rs1333049');</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;"># get all the
        alleles</span><br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family:
        arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">my @alleles =
        @{$variation->get_all_Alleles(</span><wbr style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">)};</span><br style="color: rgb(34,
        34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">foreach my
        $allele(@alleles) {</span><br style="color: rgb(34, 34, 34);
        font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style:
        normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps:
        normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">   
        if($allele->population &&
        $allele->population->name =~ /1000GENOMES.*YRI/){</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">        print</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">         
        $variation->name, "\t",</span><br style="color: rgb(34, 34,
        34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">         
        $allele->allele, "\t",</span><br style="color: rgb(34, 34,
        34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">         
        (defined($allele->frequency) ? $allele->frequency : "-"),
        "\t",</span><br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family:
        arial, sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">       
        $allele->population->name, "\n";</span><br style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">    }</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">}</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">my $genotypes =
        $variation->get_all_Population</span><wbr style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline
        !important; float: none;">Genotypes();</span><br style="color:
        rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size:
        12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">foreach my
        $genotype (@{$genotypes}) {</span><br style="color: rgb(34, 34,
        34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">   
        if($genotype->population &&
        $genotype->population->name =~ /1000GENOMES.*YRI/){</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">       print
        "Population ", $genotype->population->name, " has genotype
        ", $genotype->genotype_string, " with the frequency ",
        $genotype->frequency, "\n";</span><br style="color: rgb(34,
        34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px;
        font-style: normal; font-variant-ligatures: normal;
        font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing:
        normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px;
        text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
        word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">    }</span><br
        style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
        font-size: 12.8px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
        normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255);">
      <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 12.8px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2;
        text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none;
        white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
        -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255,
        255); display: inline !important; float: none;">}</span></p>
  </body>
</html>