<div dir="ltr">Hi Ensembl Team<div><br></div><div>I set up the ensembl database with several species. I also set up the REST API. Everything works fine.</div><div><br></div><div>Now I have loaded custom species files into a new database (created the schema, loaded sequences, loaded GFF, ...)</div><div><br></div><div>If I now go the the REST API on the address: GET info/species I can see my new specie. Also if I connect to the database and check the tables gene, transcript and exon, everything looks fine.</div><div><br></div><div>Now my issue: I have an entry in the gene table of my custom specie. The gene has the stable_id :123456 (just some ID). If I go now to the REST API and lookup for this id:</div><div><br></div><div>GET lookup/id/123456</div><div><br></div><div>I do not retrieve the gene. It seems like I have missed something.</div><div><br></div><div>Any ideas?</div><div><br></div><div>regads,</div><div>David</div><div><br></div><div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="tahoma, sans-serif">David Herzig</font></div><div dir="ltr"><font face="tahoma, sans-serif">Scientific Application Developer<br>SIAD Solution Delivery & Architecture, pRED Informatics<br>Roche Pharma Research and Early Development<br>Roche Innovation Center Basel<br><br>F. Hoffmann-La Roche Ltd<br>Grenzacherstrasse 124<br>4070 Basel<br>Switzerland<br>Phone +41 61 687 31 70</font><p style="font-family:arial;font-size:small"><span lang="DE" style="font-family:Imago"><span style="font-family:arial,sans-serif;color:black;font-size:10pt"><font face="tahoma, sans-serif">Learn more about pRED Informatics at </font></span><a href="http://go.roche.com/pREDi" style="color:rgb(17,85,204);font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333339691162px" target="_blank"><span style="font-size:12.8000001907349px">http://go.roche.com/</span><b style="font-size:12.8000001907349px">pREDi</b></a><br></span></p></div></div></div></div></div>
</div></div>