<div dir="ltr">Hi John,<div><br></div><div>I've just run a basic test and it seems to work fine for basic consequence calling.</div><div><br></div><div>We don't make any guarantees on backwards compatibility of software/cache combinations. You may run into issues using, for example, --check_existing or --sift.</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 2 March 2017 at 20:58, John M.C. Ma <span dir="ltr"><<a href="mailto:manchunjohn-ma@uiowa.edu" target="_blank">manchunjohn-ma@uiowa.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi all,<br>
<br>
To put it simply, does modern versions of VEP (85, 86 or 87 are fine)<br>
work with the old VEP cache archives from the Ensembl FTP site?<br>
<br>
Specifically, my collaborator have some data that would preferably be<br>
analyzed with mm9, and the last Ensembl release with this assembly is<br>
e67. While I haven't attempted to run VEP with this cache, my attempt<br>
in using <a href="http://convert_cache.pl" rel="noreferrer" target="_blank">convert_cache.pl</a> in VEP85 or 86 failed.<br>
<br>
So, can anyone confirm whether I can use an old VEP cache with a newer<br>
VEP or not? Thanks!<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
John MC Ma<br>
Postdoctoral Fellow<br>
Department of Lymphoma/Myeloma<br>
University of Texas MD Anderson Cancer Center<br>
Houston, Texas, USA<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.ensembl.org/<wbr>mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br></div>