<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Hello, <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">I'm having a hard time getting my hands on the best, most recent VCF datasets, mapped to GRCh38/hg38, of SNP/indel and CNV/SV variations, which I could then filter according to commonality in the general population to obtain a list of common-only variants. My question is thus two-fold:</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">1) What is the best source for such variations, and <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">2) Are there any instructions on how the variant frequency is encoded (does it correspond to E_freq, as per <a href="ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-91/variation/vcf/homo_sapiens/README">ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-91/variation/vcf/homo_sapiens/README</a>), and how to filter for this?</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">I realize I've asked a version of this question a few days ago, but now would love more details.<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Thank-you & happy holidays!<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Best,</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Jessie<br></div></div>