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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">I’ve been trying to run a script which we’ve been using for a while, but it’s hanging whilst trying to load the registry.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Has anything changed in the way we’re supposed to do this, or is there some problem on the public mysql server at the moment?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">The code which is hanging is just:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">my $registry = 'Bio::EnsEMBL::Registry';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">$registry->load_registry_from_db(<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                                 -host => 'ensembldb.ensembl.org',<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                                 -user => 'anonymous'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">                                );<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Simon.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><o:p></o:p><o:p></o:p><span style="font-size:8.0pt;
font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">The Babraham Institute, Babraham Research Campus, Cambridge CB22 3AT
</span><i><span style="font-size:
8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#365F91;mso-themecolor:accent1;
mso-themeshade:191">Registered Charity No. 1053902.</span></i><span style="font-size:8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:8.0pt;
font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">The information transmitted in this email is directed only to the addressee. If you received this in error, please contact the sender
 and delete this email from your system. The contents of this e-mail are the views of the sender and do not necessarily represent the views of the Babraham Institute.
</span><span style="font-size:8.0pt;
font-family:"Arial","sans-serif";color:#365F91;mso-themecolor:accent1;
mso-themeshade:191">Full conditions at:
</span><a href="http://www.babraham.ac.uk/terms"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#365F91;mso-themecolor:accent1;mso-themeshade:191">www.babraham.ac.uk</span></a><span style="font-size:8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#365F91;
mso-themecolor:accent1;mso-themeshade:191"><o:p></o:p></span></p>
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