<div dir="ltr"><div>Hello,</div><div><br></div><div>I just started learning the compara API. However, I am still not sure whether it can address my questions. I am wondering if someone could give me some guidance and example scripts. Here is my question: (1) I want to identify all paralogous DNA fragments (not neccessarily genes) in a genome. One genomic regions may have more than one duplicate. (2) Then, I want to find in which of the other species, the two paralogous DNAs have a common ancestor. </div><div>Alternatively, I can focus on two genomic regions in a genome to test if they are paralogous, and then which species has their common ancestral DNA</div><div>How could I get this done using compara API (version 95)?</div><div><br></div><div>Many thanks!</div><div><br></div><div>Jinrui</div></div>