<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif;font-size:small">Hi Garth!</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif;font-size:small">Yes, that's the file I need! I will check back in a week. <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif;font-size:small">Thanks so much!! :) <br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, 24 Oct 2022 at 12:34, <<a href="mailto:ilsley@ebi.ac.uk">ilsley@ebi.ac.uk</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg-3572940887120707857"><div style="overflow-wrap: break-word;" lang="EN-GB"><div class="m_-3572940887120707857WordSection1"><p class="MsoNormal">Dear Julie,<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Thank you for letting us know. The file homo_sapiens.GRCh38.motif_features.gff.gz is missing from this directory, and we plan to restore it for 107. Unfortunately, we need to regenerate this file, which will take about a week. The file for 108 is also missing (a known issue), but this one will be fixed more quickly, hopefully by tomorrow. <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Is homo_sapiens.GRCh38.motif_features.gff.gz the file you are looking for? (We aren’t planning on placing the chromosome specific files there, as these duplicate information from the main file, and we aim to avoid unnecessary disk storage.)<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Best wishes,<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Garth<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><div style="border-color:rgb(225,225,225) currentcolor currentcolor;border-style:solid none none;border-width:1pt medium medium;padding:3pt 0cm 0cm"><p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US">From:</span></b><span lang="EN-US"> Dev <<a href="mailto:dev-bounces@ensembl.org" target="_blank">dev-bounces@ensembl.org</a>> <b>On Behalf Of </b>Julie Sullivan<br><b>Sent:</b> 24 October 2022 11:52<br><b>To:</b> <a href="mailto:dev@ensembl.org" target="_blank">dev@ensembl.org</a><br><b>Subject:</b> [ensembl-dev] missing Motif features file for v107 - Homo_sapiens.GRCh38.motif_features.gff.gz<u></u><u></u></span></p></div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif">I see all the files in the previous release:<u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><u></u> <u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><a href="https://ftp.ensembl.org/pub/release-106/regulation/homo_sapiens/MotifFeatures/" target="_blank">https://ftp.ensembl.org/pub/release-106/regulation/homo_sapiens/MotifFeatures/</a><u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><u></u> <u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif">But I don't see them in version 107:<u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><u></u> <u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><a href="https://ftp.ensembl.org/pub/release-107/regulation/homo_sapiens/MotifFeatures/" target="_blank">https://ftp.ensembl.org/pub/release-107/regulation/homo_sapiens/MotifFeatures/</a><u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><u></u> <u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif">Have they been moved? If not, can they be restored?<u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif"><u></u> <u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif">Thanks!<u></u><u></u></span></p></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:12pt;font-family:"Trebuchet MS",sans-serif">Julie<u></u><u></u></span></p></div></div></div></div>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org" target="_blank">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="https://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev_ensembl.org" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev_ensembl.org</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</div></blockquote></div>