<div dir="ltr">A related question, is there a function that calculates/returns LD for a pair of variants in a specific population?<div><br></div><div>Because you can use that to calculate a relationship matrix and do your own clustering.<div><br></div><div>Mike</div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 2 October 2014 14:22, Genomeo Dev <span dir="ltr"><<a href="mailto:genomeodev@gmail.com" target="_blank">genomeodev@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>I have a list of SNPs which I want to cluster into Linkage disequilibrium blocks assuming European ancestry. I was wondering whether there is a quick way to do that using Ensembl variation API?</div><div><br></div><div>Thanks!</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">G.</div>
</font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list¬† ¬† <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>